NGS Core Facility

NGS Core Facility

Next-Generation Sequenzierung Einrichtung @ MPIB

 

 

 

 

 

 

 

 

Die NGS-Einrichtung bietet verschiedene Next-Generation Sequencing-Dienste mit den unten aufgeführten Instrumenten an.

  • Sequencer:     Illumina NextSeq 500, NovaSeq 6000*, Oxford Nanopore MinION*
  • Automation:   TECAN Freedom EVO, Beckman Coulter i7 hybrid*
  • Single Cell:   10x Genomics Chromium
  • Lab on Chip:   Agilent 2100 Bioanalyzer, 4200 TapeStation
  • qPCR:   Roche LightCycler 480 II
  • Fluorometer:   Invitrogen Qubit 4, Flexi
  • Sonication:   Covaris E220

     * Wird ab dem 3. Quartal 2022 in Betrieb sein


Unterstützung bei der Vorbereitung von Bibliotheken und der Qualitätskontrolle für verschiedene Anwendungen (einige Beispiele unten, aber nicht beschränkt auf):

  • RNA-Seq: rRNA depletion-total RNA, mRNAseq, miRNAseq
  • DNA-Seq: ChIP-Seq, Cut&Tag seq, Hi-Cseq, Micro-Cseq, WGS
  • Single Cell: scRNAseq, scATACseq, snRNAseq, seRNAseq
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