NGS Core Facility

Next-Generation Sequenzierung Einrichtung @ MPIB

Die NGS-Einrichtung bietet verschiedene Next-Generation Sequencing-Dienste mit den unten aufgeführten Instrumenten an.

• Sequencer:     Illumina NextSeq 500, NovaSeq 6000, Oxford Nanopore MinION*/PromethION**
• Automation:   TECAN Freedom EVO, Beckman Coulter i7 hybrid*
• Single Cell:   10x Genomics Chromium
• Lab on Chip:   Agilent 2100 Bioanalyzer, 4200 TapeStation
• qPCR:   Roche LightCycler 480 II
• Fluorometer:   Invitrogen Qubit 3/4, Flexi
• Sonication:   Covaris E220

     * Wird ab dem 4. Quartal 2022 in Betrieb sein

     ** Wird ab dem 1/2. Quartal 2023 in Betrieb sein

Unterstützung bei der Vorbereitung von Bibliotheken und der Qualitätskontrolle für verschiedene Anwendungen (einige Beispiele unten, aber nicht beschränkt auf):

• RNA-Seq: rRNA depletion-total RNA, mRNAseq, miRNAseq
• DNA-Seq: ChIP-Seq, Cut&Tag seq, Hi-Cseq, Micro-Cseq, WGS
• Single Cell: scRNAseq, scATACseq, snRNAseq, seRNAseq

Unterstützende Datenanalyse mit Bioinformatics Core Facility

Unser NGS-Service steht anderen MPI-Forschungsabteilungen und -gruppen offen. Fühlen Sie sich frei uns zu kontaktieren! ngs@biochem.mpg.de