NGS Core Facility
Next-Generation Sequenzierung Einrichtung @ MPIB
Die NGS-Einrichtung bietet verschiedene Next-Generation Sequencing-Dienste mit den unten aufgeführten Instrumenten an.
- Sequencer: NovaSeq 6000, AVITI, NextSeq 500, Oxford Nanopore MinION, PromethION
- Automation: Beckman Coulter i7 hybrid, TECAN Freedom EVO 100
- Single Cell: 10x Genomics Chromium iX
- Lab on Chip: 4200 TapeStation
- qPCR: Roche LightCycler 480 II
- Fluorometer: Qubit Flexi & 3/4
- Sonication: Covaris E220
Unterstützung bei der Vorbereitung von Bibliotheken und der Qualitätskontrolle für verschiedene Anwendungen (einige Beispiele unten, aber nicht beschränkt auf):
- RNA-Seq: rRNA depletion-total RNA, mRNAseq, miRNAseq
- DNA-Seq: ChIP-Seq, Cut&Tag seq, Hi-Cseq, Micro-Cseq, WGS
- Single Cell: scRNAseq, scATACseq, snRNAseq, seRNAseq
Unterstützende Datenanalyse mit Bioinformatics Core Facility
Unser NGS-Service steht anderen MPI-Forschungsabteilungen und -gruppen offen. Fühlen Sie sich frei uns zu kontaktieren! ngs@biochem.mpg.de