Publikationen von Matthias Mann

Rosenberger, F. A.; Thielert, M.; Strauss, M. T.; Schweizer, L.; Ammar, C.; Mädler, S. C.; Metousis, A.; Skowronek, P.; Wahle, M.; Madden, K. et al.; Gote-Schniering, J.; Semenova, A.; Schiller, H. B.; Rodriguez, E.; Nordmann, T. M.; Mund, A.; Mann, M.: Spatial single-cell mass spectrometry defines zonation of the hepatocyte proteome. Nature Methods 20 (10), S. 1530 - 1536 (2023)

Sharifi, M. A.; Wierer, M.; Dang, T. A.; Milic, J.; Moggio, A.; Sachs, N.; von Scheidt, M.; Hinterdobler, J.; Mueller, P.; Werner, J. et al.; Stiller, B.; Aherrahrou, Z.; Erdmann, J.; Zaliani, A.; Graettinger, M.; Reinshagen, J.; Gul, S.; Gribbon, P.; Maegdefessel, L.; Bernhagen, J.; Sager, H. B.; Mann, M.; Schunkert, H.; Kessler, T.: ADAMTS-7 Modulates Atherosclerotic Plaque Formation by Degradation of TIMP-1. Circulation Research 133 (8), S. 674 - 686 (2023)

Henneberg, L. T.; Singh, J.; Duda, D. M.; Baek, K.; Yanishevski, D.; Murray, P. J.; Mann, M.; Sidhu, S. S.; Schulman, B. A.: Activity-based profiling of cullin-RING E3 networks by conformation-specific probes. Nature Chemical Biology (2023)

Tretter, C.; Kraetzig, N. d. A.; Pecoraro, M.; Lange, S.; Seifert, P.; von Frankenberg, C.; Untch, J.; Zuleger, G.; Wilhelm, M.; Zolg, D. P. P. et al.; Dreyer, F. S. S.; Braeunlein, E.; Engleitner, T.; Uhrig, S.; Boxberg, M.; Steiger, K.; Slotta-Huspenina, J.; Ochsenreither, S.; von Bubnoff, N.; Bauer, S.; Boerries, M.; Jost, P. J. J.; Schenck, K.; Dresing, I.; Bassermann, F.; Friess, H.; Reim, D.; Gruetzmann, K.; Pfuetze, K.; Klink, B.; Schroeck, E.; Haller, B.; Kuster, B.; Mann, M.; Weichert, W.; Froehling, S.; Rad, R.; Hiltensperger, M.; Krackhardt, A. M. M.: Proteogenomic analysis reveals RNA as a source for tumor-agnostic neoantigen identification. Nature Communications 14 (1), 4632 (2023)

Bahrami, E.; Schmid, J. P.; Jurinovic, V.; Becker, M.; Wirth, A.-K.; Ludwig, R.; Kreissig, S.; Duque Angel, T. V.; Amend, D.; Hunt, K. et al.; Oellinger, R.; Rad, R.; Frenz, J. M.; Solovey, M.; Ziemann, F.; Mann, M.; Vick, B.; Wichmann, C.; Herold, T.; Jayavelu, A. K.; Jeremias, I.: Combined proteomics and CRISPR-Cas9 screens in PDX identify ADAM10 as essential for leukemia in vivo. Molecular Cancer 22 (1), 107 (2023)

Polychronidou, M.; Hou, J.; Babu, M. M.; Liberali, P.; Amit, I.; Deplancke, B.; Lahav, G.; Itzkovitz, S.; Mann, M.; Saez-Rodriguez, J. et al.; Theis, F.; Eils, R.: Single-cell biology: what does the future hold? Molecular Systems Biology 19, e11799 (2023)

Shalon, D.; Culver, R. N.; Grembi, J. A.; Folz, J.; Treit, P. V.; Shi, H.; Rosenberger, F. A.; Dethlefsen, L.; Meng, X.; Yaffe, E. et al.; Aranda-Diaz, A.; Geyer, P. E.; Mueller-Reif, J. B.; Spencer, S.; Patterson, A. D.; Triadafilopoulos, G.; Holmes, S. P.; Mann, M.; Fiehn, O.; Relman, D. A.; Huang, K. C.: Profiling the human intestinal environment under physiological conditions. Nature 617 (7961), S. 581 - 591 (2023)

Baek, K.; Scott, D. C.; Henneberg, L. T.; King, M. T.; Mann, M.; Schulman, B. A.: Systemwide disassembly and assembly of SCF ubiquitin ligase complexes. Cell 186 (9), S. 1895 - 1911 (2023)

Ugur, E.; de la Porte, A.; Qin, W.; Bultmann, S.; Ivanova, A.; Drukker, M.; Mann, M.; Wierer, M.; Leonhardt, H.: Comprehensive chromatin proteomics resolves functional phases of pluripotency and identifies changes in regulatory components. Nucleic Acids Research (2023)

Nagao, H.; Cai, W.; Brandao, B. B.; Wewer Albrechtsen, N. J.; Steger, M.; Gattu, A. K.; Pan, H.; Dreyfuss, J. M.; Wunderlich, F. T.; Mann, M. et al.; Kahn, C. R.: Leucine-973 is a crucial residue differentiating insulin and IGF-1 receptor signaling. The Journal of Clinical Investigation 133 (4), e161472 (2023)

Bernhardt, A. M.; Tiedt, S.; Teupser, D.; Dichgans, M.; Meyer, B.; Gempt, J.; Kuhn, P.-H.; Simons, M.; Palleis, C.; Weidinger, E. et al.; Nuebling, G.; Holdt, L.; Hoenikl, L.; Gasperi, C.; Giesbertz, P.; Mueller, S. A.; Breimann, S.; Lichtenthaler, S. F.; Kuster, B.; Mann, M.; Imhof, A.; Barth, T.; Hauck, S. M.; Zetterberg, H.; Otto, M.; Weichert, W.; Hemmer, B.; Levin, J.: A unified classification approach rating clinical utility of protein biomarkers across neurologic diseases. EBioMedicine 89, 104456 (2023)

Herchenroether, A.; Gossen, S.; Friedrich, T.; Reim, A.; Daus, N.; Diegmueller, F.; Leers, J.; Sani, H. M.; Gerstner, S.; Schwarz, L. et al.; Stellmacher, I.; Szymkowiak, L. V.; Nist, A.; Stiewe, T.; Borggrefe, T.; Mann, M.; Mackay, J. P.; Bartkuhn, M.; Borchers, A.; Lan, J.; Hake, S. B.: The H2A.Z and NuRD associated protein HMG20A controls early head and heart developmental transcription programs. Nature Communications 14 (1), 472 (2023)

Skowronek, P.; Krohs, F.; Lubeck, M.; Wallmann, G.; Itang, E. C.M.; Koval, P.; Wahle, M.; Thielert, M.; Meier, F.; Willems, S. et al.; Raether, O.; Mann, M.: Synchro-PASEF Allows Precursor-Specific Fragment Ion Extraction and Interference Removal in Data-Independent Acquisition. Molecular & Cellular Proteomics 22 (2), 100489 (2023)

Kessler, T.; Sager, H. B.; Mann, M.: Role of the extracellular matrix in cell-cell communication: a new therapeutic target? European Heart Journal (2023)

Lobentanzer, S.; Aloy, P.; Baumbach, J.; Bohar, B.; Carey, V. J.; Charoentong, P.; Danhauser, K.; Dogan, T.; Dreo, J.; Dunham, I. et al.; Farr, E.; Fernandez-Torras, A.; Gyori, B. M.; Hartung, M.; Hoyt, C. T.; Klein, C.; Korcsmaros, T.; Maier, A.; Mann, M.; Ochoa, D.; Pareja-Lorente, E.; Popp, F.; Preusse, M.; Probul, N.; Schwikowski, B.; Sen, B.; Strauss, M. T.; Turei, D.; Ulusoy, E.; Waltemath, D.; Wodke, J. A. H.; Saez-Rodriguez, J.: Democratizing knowledge representation with BioCypher. Nature Biotechnology (2023)

Salehi, S.; Zare, A.; Prezza, G.; Bader, J.; Schneider, C.; Fischer, U.; Meissner, F.; Mann, M.; Briese, M.; Sendtner, M.: Cytosolic Ptbp2 modulates axon growth in motoneurons through axonal localization and translation of Hnrnpr. Nature Communications 14 (1), 4158 (2023)

Wuyts, S.; Alves, R.; Zimmermann-Kogadeeva, M.; Nishijima, S.; Blasche, S.; Driessen, M.; Geyer, P. E.; Hercog, R.; Kartal, E.; Maier, L. et al.; Müller, J. B.; Santamarina, S. G.; Schmidt, T. S. B.; Sevin, D. C.; Telzerow, A.; Treit, P. V.; Wenzel, T.; Typas, A.; Patil, K. R.; Mann, M.; Kuhn, M.; Bork, P.: Consistency across multi-omics layers in a drug-perturbed gut microbial community. Molecular Systems Biology, e11525 (2023)

Bader, J. M.; Deigendesch, N.; Misch, M.; Mann, M.; Koch, A.; Meissner, F.: Proteomics separates adult-type diffuse high- grade gliomas in metabolic subgroups independent of 1p/19q codeletion and across IDH mutational status. Cell Reports Medicine 4 (1), 100877 (2022)

Bhatia, H. S.; Brunner, A.-D.; Oeztuerk, F.; Kapoor, S.; Rong, Z.; Mai, H.; Thielert, M.; Ali, M.; Al-Maskari, R.; Paetzold, J. C. et al.; Kofler, F.; Todorov, M. I.; Molbay, M.; Kolabas, Z. I.; Negwer, M.; Hoeher, L.; Steinke, H.; Dima, A.; Gupta, B.; Kaltenecker, D.; Caliskan, O. S.; Brandt, D.; Krahmer, N.; Mueller, S.; Lichtenthaler, S. F.; Hellal, F.; Bechmann, I.; Menze, B.; Theis, F.; Mann, M.; Ertuerk, A.: Spatial proteomics in three-dimensional intact specimens. Cell 185 (26), S. 5040 - 5058 (2022)

Murgia, M.; Brocca, L.; Monti, E.; Franchi, M. V. V.; Zwiebel, M.; Steigerwald, S.; Giacomello, E.; Sartori, R.; Zampieri, S.; Capovilla, G. et al.; Gasparini, M.; Biolo, G.; Sandri, M.; Mann, M.; Narici, M. V. V.: Plasma proteome profiling of healthy subjects undergoing bed rest reveals unloading-dependent changes linked to muscle atrophy. Journal of Cachexia, Sarcopenia and Muscle (2022)