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Zeitschriftenartikel (7)

1.
Zeitschriftenartikel
Sinitcyn, P.; Rudolph, J. D.; Cox, J.: Computational Methods for Understanding Mass Spectrometry-Based Shotgun Proteomics Data. Annual Review of Biomedical Data Science 1 (1), S. 207 - 234 (2018)
2.
Zeitschriftenartikel
Shurtleff, M. J.; Itzhak, D. N.; Hussmann, J. A.; Oakdale, N. T. S.; Costa, E. A.; Jonikas, M.; Weibezahn, J.; Popova, K. D.; Jan, C. H.; Sinitcyn, P. et al.; Vembar, S. S.; Hernandez, H.; Cox, J.; Burlingame, A. L.; Brodsky, J.; Frost, A.; Borner, G. H. H.; Weissman, J. S.: The ER membrane protein complex interacts cotranslationally to enable biogenesis of multipass membrane proteins. eLife 7, e37018 (2018)
3.
Zeitschriftenartikel
Sinitcyn, P.; Tiwary, S.; Rudolph, J.; Gutenbrunner, P.; Wichmann, C.; Yilmaz, S.; Hamzeiy, H.; Salinas, F.; Cox, J.: MaxQuant goes Linux. Nature methods 15 (6), S. 401 - 401 (2018)
4.
Zeitschriftenartikel
Bassani-Sternberg, M.; Braunlein, E.; Klar, R.; Engleitner, T.; Sinitcyn, P.; Audehm, S.; Straub, M.; Weber, J.; Slotta-Huspenina, J.; Specht, K. et al.; Martignoni, M. E.; Werner, A.; Hein, R.; Busch, D. H.; Peschel, C.; Rad, R.; Cox, J.; Mann, M.; Krackhardt, A. M.: Direct identification of clinically relevant neoepitopes presented on native human melanoma tissue by mass spectrometry. Nature Communications 7, 13404 (2016)
5.
Zeitschriftenartikel
Grassl, N.; Kulak, N. A.; Pichler, G.; Geyer, P. E.; Jung, J.; Schubert, S.; Sinitcyn, P.; Cox, J.; Mann, M.: Ultra-deep and quantitative saliva proteome reveals dynamics of the oral microbiome. GENOME MEDICINE 8, 44 (2016)
6.
Zeitschriftenartikel
Tyanova, S.; Temu, T.; Sinitcyn, P.; Carlson, A.; Hein, M. Y.; Geiger, T.; Mann, M.; Cox, J.: The Perseus computational platform for comprehensive analysis of (prote)omics data. Nature methods 13 (9), S. 731 - 740 (2016)
7.
Zeitschriftenartikel
Tyanova, S.; Temu, T.; Carlson, A.; Sinitcyn, P.; Mann, M.; Cox, J.: Visualization of LC-MS/MS proteomics data in MaxQuant. PROTEOMICS 15 (8), S. 1453 - 1456 (2015)

Meeting Abstract (1)

8.
Meeting Abstract
Braeunlein, E.; Lupoli, G.; Pecoraro, M.; Engleitner, T.; Stelzl, A.; Boxberg, M.; Sinitcyn, P.; Cox, J.; Steiger, K.; Weichert, W. et al.; Rad, R.; Mann, M.; Krackhardt, A. M.: Spatial and temporal monitoring of neoantigen-specific T cells and T-cell receptors in a melanoma patient with secondary immune resistance to Ipilimumab. In Oncology Research and Treatment, 41 (Suppl. 4), S. 85 - 86. Jahrestagung der Deutschen, Österreichischen und Schweizerischen Gesellschaften für Hämatologie und Medizinische Onkologie, Wien, 28. September 2018 - 02. Oktober 2018. Karger, Basel (2018)
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