Publications of Marvin Thielert

Itang, E. C. M.; Albrecht, V.; Schebesta, A.-S.; Thielert, M.; Lanz, A.-L.; Danhauser, K.; Jin, J.; Prell, T.; Strobel, S.; Klein, C. et al.; Mann, M.; Pangratz-Fuehrer, S.; Mueller-Reif, J. B.: Ontology-guided clustering enables proteomic analysis of rare pediatric disorders. Embo Molecular Medicine (2025)

Nordmann, T. M.; Anderton, H.; Hasegawa, A.; Schweizer, L.; Zhang, P.; Stadler, P.-C.; Sinha, A.; Metousis, A.; Rosenberger, F. A.; Zwiebel, M. et al.; Satoh, T. K.; Anzengruber, F.; Strauss, M. T.; Tanzer, M. C.; Saito, Y.; Gong, T.; Thielert, M.; Kimura, H.; Silke, N.; Rodriguez, E.; Restivo, G.; Nguyen, H. H.; Gross, A.; Feldmeyer, L.; Joerg, L.; Levesque, M. P.; Murray, P. J.; Ingen-Housz-Oro, S.; Mund, A.; Abe, R.; Silke, J.; Ji, C.; French, L. E.; Mann, M.: Spatial proteomics identifies JAKi as treatment for a lethal skin disease. Nature 635 (8040), pp. 1001 - 1009 (2024)

Wahle, M.; Thielert, M.; Zwiebel, M.; Skowronek, P.; Zeng, W.-F.; Mann, M.: IMBAS-MS discovers organ-specific HLA peptide patterns in plasma. Molecular & Cellular Proteomics 23 (1), 100689 (2024)

Nordmann, T. M.; Schweizer, L.; Metousis, A.; Thielert, M.; Rodriguez, E.; Rahbek-Gjerdrum, L. M.; Stadler, P. C.; Bzorek, M.; Mund, A.; Rosenberger, F. A. et al.; Mann, M.: A Standardized and Reproducible Workflow for Membrane Glass Slides in Routine Histology and Spatial Proteomics. Molecular & Cellular Proteomics 22 (10), 100643 (2023)

Rosenberger, F. A.; Thielert, M.; Strauss, M. T.; Schweizer, L.; Ammar, C.; Mädler, S. C.; Metousis, A.; Skowronek, P.; Wahle, M.; Madden, K. et al.; Gote-Schniering, J.; Semenova, A.; Schiller, H. B.; Rodriguez, E.; Nordmann, T. M.; Mund, A.; Mann, M.: Spatial single-cell mass spectrometry defines zonation of the hepatocyte proteome. Nature Methods 20 (10), pp. 1530 - 1536 (2023)

Thielert, M.; Itang, E. C. M.; Ammar, C.; Rosenberger, F. A.; Bludau, I.; Schweizer, L.; Nordmann, T. M.; Skowronek, P.; Wahle, M.; Zeng, W.-F. et al.; Zhou, X.-X.; Brunner, A.-D.; Richter, S.; Levesque, M. P.; Theis, F. J.; Steger, M.; Mann, M.: Robust dimethyl-based multiplex-DIA doubles single-cell proteome depth via a reference channel. Molecular Systems Biology 19 (9), e1150 (2023)

Rosenberger, F. A.; Thielert, M.; Mann, M.: Making single-cell proteomics biologically relevant. Nature Methods 20 (3), pp. 320 - 323 (2023)

Skowronek, P.; Krohs, F.; Lubeck, M.; Wallmann, G.; Itang, E. C. M.; Koval, P.; Wahle, M.; Thielert, M.; Meier, F.; Willems, S. et al.; Raether, O.; Mann, M.: Synchro-PASEF Allows Precursor-Specific Fragment Ion Extraction and Interference Removal in Data-Independent Acquisition. Molecular & Cellular Proteomics 22 (2), 100489 (2023)

Bhatia, H. S.; Brunner, A.-D.; Oeztuerk, F.; Kapoor, S.; Rong, Z.; Mai, H.; Thielert, M.; Ali, M.; Al-Maskari, R.; Paetzold, J. C. et al.; Kofler, F.; Todorov, M. I.; Molbay, M.; Kolabas, Z. I.; Negwer, M.; Hoeher, L.; Steinke, H.; Dima, A.; Gupta, B.; Kaltenecker, D.; Caliskan, O. S.; Brandt, D.; Krahmer, N.; Mueller, S.; Lichtenthaler, S. F.; Hellal, F.; Bechmann, I.; Menze, B.; Theis, F.; Mann, M.; Ertuerk, A.: Spatial proteomics in three-dimensional intact specimens. Cell 185 (26), pp. 5040 - 5058 (2022)

Skowronek, P.; Thielert, M.; Voytik, E.; Tanzer, M. C.; Hansen, F. M.; Willems, S.; Karayel, O.; Brunner, A.-D.; Meier, F.; Mann, M.: Rapid and in-depth coverage of the (phospho-) proteome with deep libraries and optimal window design for dia-PASEF. Molecular & Cellular Proteomics 21 (9), 100279 (2022)

Brunner, A.-D.; Thielert, M.; Vasilopoulou, C.; Ammar, C.; Coscia, F.; Mund, A.; Hoerning, O. B.; Bache, N.; Apalategui, A.; Lubeck, M. et al.; Richter, S.; Fischer, D. S.; Raether, O.; Park, M. A.; Meier, F.; Theis, F. J.; Mann, M.: Ultra-high sensitivity mass spectrometry quantifies single-cell proteome changes upon perturbation. Molecular Systems Biology 18 (3), e10798 (2022)

Thielert, M.: Technological advances to make single-cell and spatial proteomics biological relevant. Dissertation, Ludwig-Maximilians-Universität München, Fakultät für Chemie und Pharmazie, München (2024)