Publications of Sule Yilmaz

Journal Article (5)

1.
Journal Article
Yilmaz, S.; Busch, F.; Nagaraj, N.; Cox, J.: Accurate and Automated High-Coverage Identification of Chemically Cross-Linked Peptides with MaxLynx. Analytical Chemistry 94 (3), pp. 1608 - 1617 (2022)
2.
Journal Article
Sinitcyn, P.; Hamzeiy, H.; Salinas Soto, F.; Itzhak, D.; McCarthy, F.; Wichmann, C.; Steger, M.; Ohmayer, U.; Distler, U.; Kaspar-Schoenefeld, S. et al.; Prianichnikov, N.; Yilmaz, S.; Rudolph, J. D.; Tenzer, S.; Perez-Riverol, Y.; Nagaraj, N.; Humphrey, S. J.; Cox, J.: MaxDIA enables library-based and library-free data-independent acquisition proteomics. Nature Biotechnology 39, pp. 1563 - 1573 (2021)
3.
Journal Article
Iacobucci, C.; Piotrowski, C.; Aebersold, R.; Amaral, B. C.; Andrews, P.; Bernfur, K.; Borchers, C.; Brodie, N. I.; Bruce, J. E.; Cao, Y. et al.; Chaignepain, S.; Chavez, J. D.; Claverol, S.; Cox, J.; Davis, T.; Degliesposti, G.; Dong, M.-Q.; Edinger, N.; Emanuelsson, C.; Gay, M.; Goetze, M.; Gomes-Neto, F.; Gozzo, F. C.; Gutierrez, C.; Haupt, C.; Heck, A. J. R.; Herzog, F.; Huang, L.; Hoopmann, M. R.; Kalisman, N.; Klykov, O.; Kukacka, Z.; Liu, F.; MacCoss, M. J.; Mechtler, K.; Mesika, R.; Moritz, R. L.; Nagaraj, N.; Nesati, V.; Neves-Ferreira, A. G. C.; Ninnis, R.; Novak, P.; O'Reilly, F. J.; Pelzing, M.; Petrotchenko, E.; Piersimoni, L.; Plasencia, M.; Pukala, T.; Rand, K. D.; Rappsilber, J.; Reichmann, D.; Sailer, C.; Sarnowski, C. P.; Scheltema, R. A.; Schmidt, C.; Schriemer, D. C.; Shi, Y.; Skehel, J. M.; Slavin, M.; Sobott, F.; Solis-Mezarino, V.; Stephanowitz, H.; Stengel, F.; Stieger, C. E.; Trabjerg, E.; Trnka, M.; Vilaseca, M.; Viner, R.; Xiang, Y.; Yilmaz, S.; Zelter, A.; Ziemianowicz, D.; Leitner, A.; Sinz, A.: First Community-Wide, Comparative Cross-Linking Mass Spectrometry Study. Analytical Chemistry 91 (11), pp. 6953 - 6961 (2019)
4.
Journal Article
Perez-Riverol, Y.; Csordas, A.; Bai, J.; Bernal-Llinares, M.; Hewapathirana, S.; Kundu, D. J.; Inuganti, A.; Griss, J.; Mayer, G.; Eisenacher, M. et al.; Perez, E.; Uszkoreit, J.; Pfeuffer, J.; Sachsenberg, T.; Yilmaz, S.; Tiwary, S.; Cox, J.; Audain, E.; Walzer, M.; Jarnuczak, A. F.; Ternent, T.; Brazma, A.; Vizcaino, J. A.: The PRIDE database and related tools and resources in 2019: improving support for quantification data. Nucleic Acids Research 47 (D1), pp. D442 - D450 (2019)
5.
Journal Article
Sinitcyn, P.; Tiwary, S.; Rudolph, J.; Gutenbrunner, P.; Wichmann, C.; Yilmaz, S.; Hamzeiy, H.; Salinas, F.; Cox, J.: MaxQuant goes Linux. Nature methods 15 (6), p. 401 - 401 (2018)
Go to Editor View